В идеале -по темам. И книги одного автора, конечно, вместе, но вот каких авторов делать соседями - это я каждый раз определяю по настроению :)). Иногда это писатели, которые дружили, или писатели, которые упоминали в своих произведениях книги друг друга, или писатели, которые остро полемизировали... :)
А у тебя как?